由于新型冠状病毒疫情持续扩散升级，台湾当局暂停海峡两岸大、小三通客运船舶往来，此举影响了8家台湾航运公司总计9艘船。
据台湾《联合晚报》报道，台“中央流行疫情指挥中心”宣布6日起国际游轮不得靠泊台湾港口后，岛内海运仅剩两岸海运。自2月10日起暂停两岸大、小三通的客运船舶往来。其中，经营小三通的公司共有7家，包括金门的大荣海运、金安航运、金厦海运、坤龙航运，马祖的大和航业、长亿海运和南北海运。经营大三通的只有福建海峡高速客滚航运公司与台湾东联航运联合运营的客滚船“丽娜”轮。目前，两岸海运仅剩货运直航及小三通货船未受影响。
三通指两岸之间通邮、通商与通航，但该名词多被用在两岸客运。小三通是指2001年金门、马祖、澎湖与大陆沿海的客运直航。岛内统计显示，目前大三通由“中远之星”等3家公司经营5条航线，以去年12月来说，每周往返22个航班，每周载客量约1250人，去年12月总载客量约5000人。小三通共有4条航线，今年1月正常航班约为每天52班，日载客约4000人，每周约364航班，停航后取消所有航班，估计每月影响约12万人。因此，相关企业配合疫情需要暂时停航后，除了营业损失之外，还需要支付船舶贷款以及员工薪资，亟需台湾地区政府伸出援手。